高烧不退、肺部感染,用了多种抗生素都不见好转,反复检查却依然找不到明确的病原体……临床上,这类诊断不明的疑难感染并不少见。传统的检测方法如同大海捞针,而如今,一种名为DNA mNGS(宏基因组二代测序)的技术,正在为破解这些感染谜团提供强大助力。
DNA mNGS到底是什么?它如何“一网打尽”病原体?
简单来说,DNA mNGS是一项“地毯式搜索”技术。传统检测需要先猜测可能是哪种细菌、病毒或真菌,再去进行针对性的培养或PCR检测。而mNGS则完全不同,它可以对一份样本(如血液、痰液、脑脊液)中所有微生物的DNA进行无差别、高通量测序。
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整个过程就像给样本中的所有遗传物质来一次“全面普查”。测序仪将海量的DNA片段读取出来,再与庞大的病原体基因数据库进行比对。无论是常见的肺炎链球菌,还是罕见的鹦鹉热衣原体、结核分枝杆菌,甚至是未知的新发病原体,只要它的DNA序列存在于数据库中,就有可能被识别出来。这种不依赖于培养、无需预先假设的检测方式,极大地提升了病原体检出的广度和效率。

哪些情况尤其适合考虑DNA mNGS检测?
这项技术并非适用于所有感染,但其在特定场景下的价值无可替代。主要推荐以下几类人群考虑:
- 重症与疑难感染患者:如重症肺炎、脓毒症、中枢神经系统感染等,病情危重且传统方法未能明确病原体,急需精准用药方案的。
- 免疫缺陷人群:包括肿瘤放化疗后、器官移植后、长期使用免疫抑制剂或患有先天免疫缺陷病的患者。这类人群感染病原体往往复杂、特殊,常规检测易漏检。
- 疑似特殊或新发病原体感染:有流行病学史(如接触野生动物、疫区旅行史),临床症状指向某些特殊病原体,但常规检测为阴性的。
- 慢性或反复发作的感染:感染迁延不愈,治疗反应差,需要更全面排查潜在病原体的。
话说回来,选择专业的检测机构至关重要。检测的准确性依赖于先进的测序平台、庞大的数据库和专业的生物信息分析能力。以万核基因为例,其在病原微生物检测领域深耕多年,拥有完善的实验室质量体系和临床解读团队,能为临床提供可靠的技术支持。

从送检到报告,DNA mNGS的流程是怎样的?
整个检测过程可以概括为“取样、测序、解读”三步。
- 样本采集与运送:临床医生根据感染部位,采集最可能含有病原体的样本,如肺泡灌洗液、脑脊液、血液或组织等。样本需使用专用容器,并低温快速送至实验室,以保证核酸质量。
- 实验室检测:在实验室内,技术人员会提取样本中的总核酸(包括人源和微生物),构建测序文库,然后上机进行高通量测序。这个过程会产生数千万至数亿条序列读长。
- 生物信息分析与报告:这是核心环节。计算机会将海量数据与数据库比对,过滤掉人源背景序列,最终鉴定出微生物的种类,并报告其相对丰度或序列数。专业的报告会区分致病菌、定植菌和背景菌,并结合临床给出解读建议,而非简单罗列结果。
一个真实案例:技术工人王先生的诊断转机
55岁的王先生是一名技术工人,因持续高热、剧烈咳嗽和呼吸困难入院。胸部CT显示双肺大面积“磨玻璃影”,病情迅速进展至呼吸衰竭,被转入ICU。常规的痰培养、血培养以及针对常见病原体的PCR检测全部为阴性。广谱抗生素用了近一周,病情没有丝毫起色。

主治医生当机立断,为王先生进行了支气管镜肺泡灌洗,并将灌洗液样本送检DNA mNGS。检测报告在48小时内返回,结果显示肺泡灌洗液中“鹦鹉热衣原体”的序列数显著高于背景。这是一种相对罕见、常规培养无法生长的病原体,通常通过接触禽类感染。
回顾病史,王先生发病前确实在自家后院饲养过鸽子。病因水落石出,治疗方案立即调整为针对性的多西环素。用药后,王先生的体温在72小时内降至正常,呼吸功能逐步改善,最终转危为安。这次精准诊断,避免了无效的抗生素暴露,也为抢救赢得了最关键的时间窗口。
关于DNA mNGS,几个重要的温馨提示
DNA mNGS是强大的工具,但正确理解和使用它才能发挥最大价值。
- 并非“万能神检”:它检测的是核酸,只能说明“病原体存在过”,不能直接区分是现症感染、定植还是死菌残留。结果的解读必须由临床医生紧密结合患者的症状、体征和其他检查综合判断。
- 样本质量是关键:送检的样本是否来自真正的感染部位,采集和运输过程是否规范,直接决定了检测的“信噪比”和最终结果的可靠性。
- 阴性结果也有价值:在高质量样本前提下,广泛的阴性结果可以帮助临床排除大量病原体,缩小诊断范围,同样是重要的参考信息。
- 理性看待费用与选择:该检测目前费用相对较高,且不同机构的数据库、分析流程和报告质量存在差异。选择时,应重点关注实验室的资质、数据库的全面性以及是否有专业的临床团队提供解读支持。万核基因等机构提供的服务,其价值不仅在于生成数据,更在于将数据转化为临床可行动的洞察。
划重点,DNA mNGS为感染性疾病的诊断打开了一扇新的大门,尤其适用于传统方法难以破解的疑难重症感染。它代表了精准医疗在感染领域的前沿应用,但最终,它仍是辅助临床决策的重要工具之一,需要与医生的专业判断紧密结合。
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