DNA mNGS基因检测：精准捕捉病原体的“火眼金睛”

在临床诊断领域，特别是面对复杂、疑难或危重的感染性疾病时，传统检测方法有时会显得力不从心。此时，一项名为“宏基因组二代测序”的技术，正逐渐成为辅助医生精准诊断的利器。这项技术，通常简称为DNA mNGS。

DNA mNGS究竟是什么？

说得简单些，DNA mNGS就像给一份临床样本（比如脑脊液、血液、肺泡灌洗液）进行一次超大规模的“人口普查”。它不依赖于预先培养病原体，而是直接从样本中提取出所有微生物（细菌、病毒、真菌、寄生虫）和人类宿主的DNA信息，然后通过高通量测序和强大的生物信息学分析，一次性比对成千上万种已知的病原体基因序列，从而快速锁定致病的“真凶”。这种方法无需预先猜测是哪种病原体，实现了真正的“无偏倚”检测。

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这项技术厉害在哪里？与传统方法有何不同？

传统病原学检测，比如细菌培养、特定抗原抗体检测或者PCR，都属于“钓鱼”模式：需要先有个大致怀疑方向，再用特定“鱼饵”（培养基或引物）去“钓”某一种或某一类病原体。如果猜错了方向，就可能一无所获。

DNA mNGS则是“大网捞鱼”模式。它用一张大网（高通量测序）把样本里所有的遗传物质“捞”上来，然后再通过数据库比对，识别出里面所有“鱼”的种类。这种方法尤其擅长解决那些病因不明、病情危重、免疫力低下患者（如器官移植后、肿瘤化疗后）的复杂感染，以及传统检测反复阴性但临床高度怀疑感染的病例。

哪些人最需要DNA mNGS检测？

以下几类情况，DNA mNGS往往能提供关键诊断线索：

1. 危重症感染患者：如重症肺炎、脓毒症、中枢神经系统感染等，需要快速明确病原体以指导精准治疗。
2. 免疫缺陷患者：这类人群感染病原体复杂、不典型，常规检测阳性率低。
3. 慢性或反复感染患者：长期治疗效果不佳，怀疑存在特殊或罕见病原体。
4. 疑似新发突发传染病患者：在疫情初期，传统方法可能无法识别未知病原体，mNGS有助于快速发现。

划重点，是否需要进行DNA mNGS检测，必须由临床医生根据患者的具体病情、治疗反应和常规检查结果来综合判断，它是一种强有力的补充诊断工具，而非常规筛查手段。

DNA mNGS检测是如何进行的？

整个检测流程环环相扣，大致分为以下几个步骤：

1. 样本采集与运送：医生根据感染部位，采集最可能含有病原体的样本，如血液、脑脊液、肺泡灌洗液、组织等。样本需使用专用容器，并尽快低温送至检测实验室。样本质量直接影响结果准确性。

1. 核酸提取与建库：在严格控制的实验环境下，将样本中的所有DNA提取出来，并进行片段化、加接头等处理，构建成可用于测序的“文库”。

1. 高通量测序：将构建好的文库放入高通量测序仪，进行大规模并行测序，产生海量的基因序列片段（数据）。

1. 生物信息学分析：这是核心环节。计算机会将海量序列数据与庞大的病原体基因组数据库进行比对，并严格过滤掉人类宿主背景序列，最终鉴定出样本中存在的微生物种类及其序列数。靠谱的分析需要强大的数据库和算法支撑，市面上像万核基因这样的专业机构，就因其全面的病原数据库和严谨的分析流程而受到临床信赖。

1. 报告解读：生成检测报告，列出检出的微生物列表。但检出不等于致病！报告解读至关重要，需要由经验丰富的临床医生和微生物专家结合患者临床表现、样本类型、微生物序列数、背景菌群等信息进行综合判读，区分是致病菌、定植菌还是污染。

一个真实案例：为渔业劳动者拨开迷雾

曾有一位38岁的男性渔业劳动者，因持续高热、剧烈头痛、意识模糊入院。常规的血液培养、脑脊液常规生化及常见病原体检测均为阴性。患者病情持续恶化，出现多器官功能衰竭迹象，治疗陷入僵局。鉴于其职业有接触疫水的风险，临床高度怀疑特殊病原体感染，但无法确定目标。

紧急送检脑脊液进行DNA mNGS检测。检测报告在48小时内回报，结果显示淡水鱼源创伤弧菌的序列数显著偏高。这一结果与患者的渔业工作史高度吻合，为诊断提供了决定性证据。临床立即根据该病原体的药敏特点调整了抗生素方案，患者的感染最终得到有效控制，神经功能也逐渐恢复。这个案例充分体现了DNA mNGS在诊断职业暴露相关、罕见或特殊病原体感染方面的独特价值。

关于DNA mNGS检测的几个温馨提示

• 并非万能：DNA mNGS主要检测DNA病毒、细菌、真菌、寄生虫等。对于RNA病毒（如流感病毒、新型冠状病毒），需要采用RNA mNGS方法。同时，它对结核分枝杆菌等厚壁菌的检出灵敏度有一定局限。

• 结果解读是关键：报告上列出的微生物，必须由医生结合临床判断是“致病元凶”、“正常定植”还是“实验污染”，切勿自行解读用药。

• 选择可靠机构：检测的准确性与实验室质量控制、数据库完备性、分析算法可靠性直接相关。选择有资质、与临床沟通顺畅、数据库更新及时的服务商很重要。目前，国内有多家机构提供此项服务，咨询时，可以了解其是否具备像万核基因所强调的临床级生信分析能力和本地化数据库支持。

• 费用与医保：目前DNA mNGS检测费用相对较高，且多数地区尚未纳入常规医保报销范围，检测前可就相关费用进行咨询。

• 辅助而非替代：它是对现有病原学诊断体系的重要补充和升级，但不能完全取代涂片、培养、PCR等所有传统方法。多种检测方法联合应用，才能更全面地揭示感染真相。

总之呢，DNA mNGS技术为感染性疾病的精准诊断打开了新视野。当面临诊断困境时，这项技术就像在迷雾中点亮了一盏探照灯，帮助临床医生更快、更准地找到病原体，为制定有效的治疗方案赢得宝贵时间。